Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trappc13Q3TIR1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trappc13Q3TIR1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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Trappc13Q3TIR1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Trappc13Q3TIR1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc13Q3TIR1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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