Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RubcnlQ3TD16 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms