Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col24a1Q30D77 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col24a1Q30D77 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms