Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Fam178bQ24JP3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam178bQ24JP3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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