Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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