Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cers3Q1A3B0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cers3Q1A3B0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cers3Q1A3B0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cers3Q1A3B0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cers3Q1A3B0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cers3Q1A3B0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cers3Q1A3B0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cers3Q1A3B0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cers3Q1A3B0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cers3Q1A3B0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cers3Q1A3B0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cers3Q1A3B0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cers3Q1A3B0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cers3Q1A3B0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cers3Q1A3B0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cers3Q1A3B0 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cers3Q1A3B0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cers3Q1A3B0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cers3Q1A3B0 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cers3Q1A3B0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cers3Q1A3B0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cers3Q1A3B0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cers3Q1A3B0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cers3Q1A3B0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cers3Q1A3B0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms