Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Spatc1Q148B6 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Spatc1Q148B6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Spatc1Q148B6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Spatc1Q148B6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Spatc1Q148B6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Spatc1Q148B6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Spatc1Q148B6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Spatc1Q148B6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Spatc1Q148B6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Spatc1Q148B6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Spatc1Q148B6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Spatc1Q148B6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spatc1Q148B6 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms