Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms