Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Samd12Q0VE29 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samd12Q0VE29 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms