Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntnap5bQ0V8T8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntnap5bQ0V8T8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cntnap5bQ0V8T8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntnap5bQ0V8T8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntnap5bQ0V8T8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntnap5bQ0V8T8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntnap5bQ0V8T8 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cntnap5bQ0V8T8 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cntnap5bQ0V8T8 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cntnap5bQ0V8T8 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cntnap5bQ0V8T8 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cntnap5bQ0V8T8 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cntnap5bQ0V8T8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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