Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Calb2Q08331 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Calb2Q08331 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Calb2Q08331 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Calb2Q08331 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Calb2Q08331 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Calb2Q08331 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Calb2Q08331 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Calb2Q08331 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Calb2Q08331 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Calb2Q08331 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Calb2Q08331 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Calb2Q08331 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Calb2Q08331 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Calb2Q08331 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Calb2Q08331 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Calb2Q08331 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Calb2Q08331 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Calb2Q08331 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Calb2Q08331 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Calb2Q08331 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Calb2Q08331 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Calb2Q08331 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Calb2Q08331 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Calb2Q08331 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Calb2Q08331 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Calb2Q08331 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Calb2Q08331 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Calb2Q08331 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Calb2Q08331 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Calb2Q08331 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Calb2Q08331 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Calb2Q08331 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms