Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cntn3Q07409 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cntn3Q07409 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cntn3Q07409 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cntn3Q07409 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cntn3Q07409 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cntn3Q07409 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Cntn3Q07409 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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