Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms