Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a1Q04857 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms