Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp11Q02853 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms