Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabpaQ00422 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms