Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Gbp10Q000W5 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp10Q000W5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms