Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms