Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabpb2P81069 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms