Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr4P70658 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms