Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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