Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeboxP70368 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeboxP70368 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SeboxP70368 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeboxP70368 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms