Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfi1P70338 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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