Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl39P62892 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms