Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Rab3cP62823 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Rab3cP62823 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Rab3cP62823 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Rab3cP62823 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Rab3cP62823 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Rab3cP62823 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rab3cP62823 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rab3cP62823 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab3cP62823 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms