Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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