Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms