Protein–RNA interactions for Protein: P57748

Mmp20, Matrix metalloproteinase-20, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp20P57748 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp20P57748 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp20P57748 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp20P57748 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp20P57748 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp20P57748 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp20P57748 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp20P57748 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp20P57748 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp20P57748 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp20P57748 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp20P57748 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp20P57748 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp20P57748 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Mmp20P57748 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp20P57748 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp20P57748 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp20P57748 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp20P57748 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp20P57748 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp20P57748 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp20P57748 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp20P57748 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp20P57748 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp20P57748 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Mmp20P57748 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Mmp20P57748 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Mmp20P57748 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Mmp20P57748 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Mmp20P57748 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp20P57748 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp20P57748 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp20P57748 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp20P57748 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp20P57748 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp20P57748 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Mmp20P57748 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp20P57748 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp20P57748 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp20P57748 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp20P57748 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp20P57748 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Mmp20P57748 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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