Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Cldn18P56857 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn18P56857 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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