Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Bace1P56818 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bace1P56818 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bace1P56818 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace1P56818 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace1P56818 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms