Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TdgP56581 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TdgP56581 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TdgP56581 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TdgP56581 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdgP56581 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdgP56581 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdgP56581 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdgP56581 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TdgP56581 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdgP56581 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdgP56581 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdgP56581 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TdgP56581 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdgP56581 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdgP56581 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdgP56581 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TdgP56581 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TdgP56581 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdgP56581 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdgP56581 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdgP56581 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdgP56581 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdgP56581 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdgP56581 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdgP56581 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdgP56581 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdgP56581 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdgP56581 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdgP56581 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TdgP56581 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdgP56581 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdgP56581 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdgP56581 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdgP56581 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdgP56581 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdgP56581 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdgP56581 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdgP56581 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdgP56581 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdgP56581 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdgP56581 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdgP56581 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdgP56581 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdgP56581 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdgP56581 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdgP56581 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdgP56581 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdgP56581 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdgP56581 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdgP56581 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdgP56581 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdgP56581 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdgP56581 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdgP56581 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TdgP56581 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TdgP56581 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TdgP56581 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TdgP56581 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TdgP56581 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TdgP56581 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TdgP56581 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TdgP56581 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TdgP56581 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TdgP56581 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TdgP56581 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TdgP56581 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TdgP56581 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TdgP56581 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TdgP56581 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TdgP56581 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TdgP56581 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TdgP56581 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TdgP56581 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TdgP56581 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TdgP56581 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TdgP56581 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TdgP56581 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TdgP56581 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TdgP56581 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TdgP56581 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TdgP56581 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TdgP56581 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TdgP56581 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TdgP56581 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TdgP56581 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TdgP56581 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TdgP56581 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TdgP56581 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TdgP56581 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TdgP56581 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TdgP56581 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TdgP56581 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TdgP56581 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TdgP56581 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TdgP56581 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TdgP56581 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TdgP56581 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TdgP56581 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TdgP56581 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms