Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CartptP56388 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CartptP56388 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CartptP56388 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CartptP56388 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CartptP56388 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CartptP56388 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CartptP56388 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CartptP56388 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CartptP56388 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CartptP56388 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CartptP56388 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CartptP56388 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CartptP56388 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CartptP56388 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CartptP56388 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CartptP56388 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CartptP56388 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CartptP56388 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CartptP56388 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CartptP56388 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CartptP56388 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CartptP56388 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CartptP56388 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CartptP56388 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CartptP56388 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CartptP56388 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CartptP56388 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CartptP56388 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CartptP56388 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CartptP56388 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CartptP56388 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CartptP56388 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CartptP56388 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CartptP56388 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CartptP56388 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CartptP56388 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CartptP56388 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CartptP56388 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CartptP56388 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CartptP56388 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CartptP56388 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CartptP56388 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CartptP56388 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CartptP56388 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CartptP56388 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CartptP56388 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CartptP56388 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CartptP56388 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CartptP56388 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CartptP56388 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CartptP56388 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CartptP56388 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CartptP56388 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CartptP56388 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CartptP56388 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CartptP56388 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CartptP56388 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CartptP56388 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CartptP56388 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CartptP56388 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CartptP56388 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CartptP56388 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CartptP56388 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CartptP56388 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CartptP56388 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CartptP56388 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CartptP56388 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CartptP56388 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CartptP56388 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CartptP56388 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CartptP56388 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CartptP56388 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CartptP56388 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CartptP56388 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CartptP56388 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CartptP56388 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CartptP56388 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CartptP56388 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CartptP56388 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CartptP56388 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CartptP56388 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CartptP56388 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CartptP56388 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CartptP56388 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CartptP56388 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CartptP56388 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CartptP56388 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CartptP56388 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CartptP56388 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CartptP56388 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CartptP56388 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CartptP56388 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CartptP56388 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CartptP56388 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CartptP56388 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CartptP56388 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CartptP56388 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CartptP56388 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CartptP56388 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms