Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aqp4P55088 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aqp4P55088 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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