Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TspoP50637 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TspoP50637 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TspoP50637 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TspoP50637 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
TspoP50637 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TspoP50637 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TspoP50637 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TspoP50637 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TspoP50637 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TspoP50637 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TspoP50637 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TspoP50637 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TspoP50637 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TspoP50637 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TspoP50637 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TspoP50637 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TspoP50637 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms