Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpdP50404 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpdP50404 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpdP50404 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpdP50404 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpdP50404 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms