Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtshP49935 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtshP49935 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtshP49935 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtshP49935 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtshP49935 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CtshP49935 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CtshP49935 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtshP49935 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtshP49935 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CtshP49935 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtshP49935 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CtshP49935 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtshP49935 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CtshP49935 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtshP49935 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtshP49935 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtshP49935 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtshP49935 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtshP49935 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtshP49935 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtshP49935 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtshP49935 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtshP49935 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CtshP49935 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtshP49935 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtshP49935 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtshP49935 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtshP49935 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtshP49935 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtshP49935 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtshP49935 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CtshP49935 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CtshP49935 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtshP49935 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CtshP49935 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtshP49935 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CtshP49935 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtshP49935 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtshP49935 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtshP49935 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtshP49935 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtshP49935 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtshP49935 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtshP49935 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtshP49935 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtshP49935 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtshP49935 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtshP49935 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtshP49935 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtshP49935 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtshP49935 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtshP49935 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtshP49935 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtshP49935 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtshP49935 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtshP49935 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtshP49935 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtshP49935 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtshP49935 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtshP49935 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CtshP49935 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CtshP49935 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtshP49935 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtshP49935 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtshP49935 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtshP49935 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtshP49935 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtshP49935 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtshP49935 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtshP49935 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtshP49935 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtshP49935 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtshP49935 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtshP49935 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtshP49935 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtshP49935 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtshP49935 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtshP49935 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtshP49935 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtshP49935 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtshP49935 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtshP49935 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CtshP49935 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtshP49935 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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