Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms