Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms