Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LmnaP48678 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LmnaP48678 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LmnaP48678 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LmnaP48678 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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