Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Mmp9P41245 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Mmp9P41245 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Mmp9P41245 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Mmp9P41245 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Mmp9P41245 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Mmp9P41245 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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