Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Timp3P39876 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Timp3P39876 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Timp3P39876 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Timp3P39876 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Timp3P39876 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Timp3P39876 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Timp3P39876 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Timp3P39876 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms