Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik2P39087 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik2P39087 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik2P39087 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik2P39087 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik2P39087 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik2P39087 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Grik2P39087 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Grik2P39087 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Grik2P39087 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Grik2P39087 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Grik2P39087 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Grik2P39087 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Grik2P39087 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik2P39087 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik2P39087 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik2P39087 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik2P39087 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik2P39087 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms