Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgclP38060 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HmgclP38060 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HmgclP38060 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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