Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rfc1P35601 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rfc1P35601 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rfc1P35601 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rfc1P35601 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rfc1P35601 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rfc1P35601 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rfc1P35601 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rfc1P35601 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rfc1P35601 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Rfc1P35601 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rfc1P35601 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rfc1P35601 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfc1P35601 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfc1P35601 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rfc1P35601 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rfc1P35601 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfc1P35601 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfc1P35601 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfc1P35601 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfc1P35601 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfc1P35601 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfc1P35601 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rfc1P35601 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfc1P35601 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rfc1P35601 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfc1P35601 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfc1P35601 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfc1P35601 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfc1P35601 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfc1P35601 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfc1P35601 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfc1P35601 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfc1P35601 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfc1P35601 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfc1P35601 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfc1P35601 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfc1P35601 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfc1P35601 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfc1P35601 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfc1P35601 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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