Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp4P35123 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp4P35123 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp4P35123 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp4P35123 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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