Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch4P31695 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Notch4P31695 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms