Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RxraP28700 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RxraP28700 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RxraP28700 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RxraP28700 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RxraP28700 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RxraP28700 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RxraP28700 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RxraP28700 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RxraP28700 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RxraP28700 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RxraP28700 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RxraP28700 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RxraP28700 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RxraP28700 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RxraP28700 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RxraP28700 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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RxraP28700 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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RxraP28700 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RxraP28700 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RxraP28700 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RxraP28700 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RxraP28700 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RxraP28700 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RxraP28700 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RxraP28700 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RxraP28700 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RxraP28700 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RxraP28700 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RxraP28700 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RxraP28700 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RxraP28700 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RxraP28700 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RxraP28700 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RxraP28700 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RxraP28700 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RxraP28700 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RxraP28700 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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