Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms