Protein–RNA interactions for Protein: P26450

Pik3r1, Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3r1P26450 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pik3r1P26450 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms