Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ggta1P23336 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ggta1P23336 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ggta1P23336 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ggta1P23336 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ggta1P23336 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ggta1P23336 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ggta1P23336 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ggta1P23336 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ggta1P23336 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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